1、种子的采收难，每年等到种子樱桃九成熟以后就可进行采收，但需要注意及时性。因为樱桃种子害怕发热，采收完樱桃果如果不在一小时内及时处理就会影响种子的发芽率，导致发芽率直接下降一半以上。所以采收时是最忌讳把樱桃果拉回家再加工的，而是要直接将果实装在编织袋里反复仔细的踩到果肉和种子分离，再接着在河水里将种子淘洗出来，这个过程工作量大且工作要求高需要配合默契且经验丰富的采收人员；
2、种子的储存难。传统的储存方式是按照沙藏桃核杏核处理，但这个方法容易导致芽发不出来或者是芽发得太早反而到了下地季节又不能进行种植进而影响收成；
3、保苗也难。技术、天气等因素都会影响小苗的存活；
4、嫁接过程中容易遭受病害。如果枮木品种选择不对加上土壤处理不到位就容易遭受根瘤病等病害影响导致营养供应不足，果品质量低。
